Diversidad de peces: Un nuevo estudio demuestra la eficacia de un método novedoso para utilizar ADN en muestras de agua de mar para determinar qué especies de peces están presentes en una parte determinada de las profundidades marinas. Un equipo de científicos de eDNAtec Inc. y colegas de Fisheries and Oceans Canada y Memorial University presentan estos hallazgos en la revista de acceso abierto PLOS ONE el 4 de noviembre.
La capacidad de monitorear la diversidad de peces de aguas profundas es necesaria para implementar esfuerzos de gestión sostenible y comprender los impactos de la pesca comercial y el cambio climático. Sin embargo, los métodos existentes, como las cámaras trampa con cebo, la pesca de arrastre y el monitoreo acústico, tienen capacidades de detección limitadas y son difíciles de usar en gran parte del océano.
Un método más nuevo llamado eDNA metabarcoding revela qué peces están presentes en un hábitat determinado mediante el análisis del ADN ambiental (eDNA), el ADN que los organismos arrojan al entorno circundante a medida que realizan sus actividades normales.
Para evaluar la efectividad de la metabarcoding de eDNA para detectar peces de aguas profundas, McClenaghan y sus colegas la aplicaron a muestras de agua de mar recolectadas en el Mar de Labrador a profundidades de hasta 2.500 metros. En muestras de aguas profundas (profundidades de 1400 metros o más), la codificación de metabarras de eDNA identificó 11 familias de peces, 11 géneros y 8 especies. Los investigadores compararon los resultados de su metabarcoding de eDNA con los obtenidos por métodos convencionales y encontraron que proporcionaban una cobertura más amplia de la diversidad de peces y otros taxones mientras usaban un esfuerzo logístico significativamente menor. Estas ventajas hacen que las técnicas de eDNA sean un avance importante para las aplicaciones de monitoreo a gran escala.
El equipo de investigación también exploró la codificación de metabarras de eDNA utilizando varios volúmenes de muestras de agua de mar de aguas profundas y diferentes cebadores de ADN: hebras cortas de ADN aplicadas en el análisis de laboratorio de eDNA para determinar qué especies están presentes. Sus hallazgos sugieren que el entorno del océano profundo requiere algunos ajustes en los métodos utilizados en aguas menos profundas, como el uso de mayores volúmenes de agua y el uso de múltiples cebadores para maximizar la detección de especies.
Si bien los autores planean perfeccionar aún más los procedimientos de codificación de metabarras de ADN electrónico para la naturaleza única del entorno de aguas profundas, señalan que este método ya puede proporcionar información importante para monitorear la diversidad de peces en las profundidades del océano.
Los autores añaden:»Los avances en genómica y herramientas computacionales están expandiendo rápidamente nuestra capacidad para estudiar y monitorear la biodiversidad, una tarea muy necesaria frente a un cambio ambiental rápido y vasto. Nuestro estudio demuestra la utilidad del análisis de eDNA para el desafiante esfuerzo de monitoreo especies de peces en las profundidades del océano y prepara el escenario para la adopción de este enfoque por parte de varios interesados».
Fuente: PHYS
